Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWR2

Smyd3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd3Q9CWR2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smyd3Q9CWR2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smyd3Q9CWR2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smyd3Q9CWR2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smyd3Q9CWR2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smyd3Q9CWR2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smyd3Q9CWR2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smyd3Q9CWR2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smyd3Q9CWR2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smyd3Q9CWR2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smyd3Q9CWR2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smyd3Q9CWR2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smyd3Q9CWR2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smyd3Q9CWR2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smyd3Q9CWR2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smyd3Q9CWR2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smyd3Q9CWR2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smyd3Q9CWR2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smyd3Q9CWR2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smyd3Q9CWR2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Smyd3Q9CWR2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smyd3Q9CWR2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smyd3Q9CWR2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smyd3Q9CWR2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smyd3Q9CWR2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smyd3Q9CWR2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smyd3Q9CWR2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Smyd3Q9CWR2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smyd3Q9CWR2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smyd3Q9CWR2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smyd3Q9CWR2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smyd3Q9CWR2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Smyd3Q9CWR2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Smyd3Q9CWR2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smyd3Q9CWR2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smyd3Q9CWR2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smyd3Q9CWR2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smyd3Q9CWR2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smyd3Q9CWR2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smyd3Q9CWR2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smyd3Q9CWR2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smyd3Q9CWR2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smyd3Q9CWR2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smyd3Q9CWR2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smyd3Q9CWR2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smyd3Q9CWR2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smyd3Q9CWR2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Smyd3Q9CWR2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smyd3Q9CWR2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smyd3Q9CWR2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smyd3Q9CWR2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smyd3Q9CWR2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smyd3Q9CWR2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smyd3Q9CWR2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smyd3Q9CWR2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Smyd3Q9CWR2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smyd3Q9CWR2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Smyd3Q9CWR2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smyd3Q9CWR2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smyd3Q9CWR2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms