Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NubplQ9CWD8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NubplQ9CWD8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NubplQ9CWD8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NubplQ9CWD8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NubplQ9CWD8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NubplQ9CWD8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NubplQ9CWD8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NubplQ9CWD8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NubplQ9CWD8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NubplQ9CWD8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NubplQ9CWD8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NubplQ9CWD8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NubplQ9CWD8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NubplQ9CWD8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms