Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
4930535I16RikQ9CUI2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
4930535I16RikQ9CUI2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms