Protein–RNA interactions for Protein: Q9CU62

Smc1a, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1aQ9CU62 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smc1aQ9CU62 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smc1aQ9CU62 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smc1aQ9CU62 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smc1aQ9CU62 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smc1aQ9CU62 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smc1aQ9CU62 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smc1aQ9CU62 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smc1aQ9CU62 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smc1aQ9CU62 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smc1aQ9CU62 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smc1aQ9CU62 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Smc1aQ9CU62 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smc1aQ9CU62 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smc1aQ9CU62 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smc1aQ9CU62 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smc1aQ9CU62 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smc1aQ9CU62 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smc1aQ9CU62 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smc1aQ9CU62 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smc1aQ9CU62 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smc1aQ9CU62 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smc1aQ9CU62 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smc1aQ9CU62 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smc1aQ9CU62 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smc1aQ9CU62 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smc1aQ9CU62 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smc1aQ9CU62 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc1aQ9CU62 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc1aQ9CU62 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc1aQ9CU62 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc1aQ9CU62 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc1aQ9CU62 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc1aQ9CU62 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc1aQ9CU62 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc1aQ9CU62 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc1aQ9CU62 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc1aQ9CU62 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc1aQ9CU62 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc1aQ9CU62 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc1aQ9CU62 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smc1aQ9CU62 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smc1aQ9CU62 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc1aQ9CU62 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc1aQ9CU62 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc1aQ9CU62 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc1aQ9CU62 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smc1aQ9CU62 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smc1aQ9CU62 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smc1aQ9CU62 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smc1aQ9CU62 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smc1aQ9CU62 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smc1aQ9CU62 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smc1aQ9CU62 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 278.5 ms