Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pard3bQ9CSB4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pard3bQ9CSB4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pard3bQ9CSB4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pard3bQ9CSB4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pard3bQ9CSB4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pard3bQ9CSB4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pard3bQ9CSB4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pard3bQ9CSB4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pard3bQ9CSB4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pard3bQ9CSB4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pard3bQ9CSB4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pard3bQ9CSB4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pard3bQ9CSB4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pard3bQ9CSB4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pard3bQ9CSB4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pard3bQ9CSB4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pard3bQ9CSB4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pard3bQ9CSB4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pard3bQ9CSB4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pard3bQ9CSB4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pard3bQ9CSB4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pard3bQ9CSB4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pard3bQ9CSB4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pard3bQ9CSB4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pard3bQ9CSB4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pard3bQ9CSB4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pard3bQ9CSB4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pard3bQ9CSB4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pard3bQ9CSB4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pard3bQ9CSB4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pard3bQ9CSB4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pard3bQ9CSB4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pard3bQ9CSB4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pard3bQ9CSB4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pard3bQ9CSB4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pard3bQ9CSB4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pard3bQ9CSB4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pard3bQ9CSB4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pard3bQ9CSB4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pard3bQ9CSB4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pard3bQ9CSB4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pard3bQ9CSB4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pard3bQ9CSB4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pard3bQ9CSB4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pard3bQ9CSB4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms