Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
1700029F12RikQ9CRB4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700029F12RikQ9CRB4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700029F12RikQ9CRB4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms