Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Klhl28Q9CR40 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhl28Q9CR40 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl28Q9CR40 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms