Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9CQM1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9CQM1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9CQM1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9CQM1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CQM1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CQM1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CQM1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CQM1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9CQM1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9CQM1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9CQM1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9CQM1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9CQM1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Q9CQM1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9CQM1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9CQM1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9CQM1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9CQM1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9CQM1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9CQM1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9CQM1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CQM1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CQM1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CQM1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CQM1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CQM1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CQM1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CQM1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CQM1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CQM1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CQM1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CQM1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CQM1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CQM1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CQM1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CQM1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CQM1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CQM1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CQM1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CQM1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CQM1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CQM1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CQM1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CQM1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CQM1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CQM1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CQM1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CQM1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CQM1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CQM1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CQM1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CQM1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CQM1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CQM1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CQM1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CQM1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CQM1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CQM1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CQM1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CQM1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CQM1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9CQM1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9CQM1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9CQM1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9CQM1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9CQM1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9CQM1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9CQM1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9CQM1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9CQM1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CQM1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CQM1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CQM1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CQM1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9CQM1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9CQM1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9CQM1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9CQM1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9CQM1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9CQM1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9CQM1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9CQM1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9CQM1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9CQM1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9CQM1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9CQM1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9CQM1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9CQM1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9CQM1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9CQM1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9CQM1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9CQM1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9CQM1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9CQM1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9CQM1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9CQM1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9CQM1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9CQM1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9CQM1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms