Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rdm1Q9CQK3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rdm1Q9CQK3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rdm1Q9CQK3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rdm1Q9CQK3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rdm1Q9CQK3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rdm1Q9CQK3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rdm1Q9CQK3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rdm1Q9CQK3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rdm1Q9CQK3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rdm1Q9CQK3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rdm1Q9CQK3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rdm1Q9CQK3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rdm1Q9CQK3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rdm1Q9CQK3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rdm1Q9CQK3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rdm1Q9CQK3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rdm1Q9CQK3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rdm1Q9CQK3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rdm1Q9CQK3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rdm1Q9CQK3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rdm1Q9CQK3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms