Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI9

Med30, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med30Q9CQI9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med30Q9CQI9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med30Q9CQI9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med30Q9CQI9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med30Q9CQI9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med30Q9CQI9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Med30Q9CQI9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med30Q9CQI9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med30Q9CQI9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med30Q9CQI9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med30Q9CQI9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med30Q9CQI9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med30Q9CQI9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med30Q9CQI9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med30Q9CQI9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med30Q9CQI9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med30Q9CQI9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med30Q9CQI9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med30Q9CQI9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med30Q9CQI9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med30Q9CQI9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med30Q9CQI9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med30Q9CQI9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med30Q9CQI9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med30Q9CQI9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med30Q9CQI9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med30Q9CQI9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med30Q9CQI9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med30Q9CQI9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med30Q9CQI9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med30Q9CQI9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Med30Q9CQI9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med30Q9CQI9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Med30Q9CQI9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med30Q9CQI9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med30Q9CQI9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Med30Q9CQI9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med30Q9CQI9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med30Q9CQI9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med30Q9CQI9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms