Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms