Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ91

Ndufa3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa3Q9CQ91 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ndufa3Q9CQ91 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufa3Q9CQ91 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufa3Q9CQ91 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufa3Q9CQ91 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufa3Q9CQ91 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufa3Q9CQ91 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufa3Q9CQ91 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufa3Q9CQ91 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufa3Q9CQ91 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufa3Q9CQ91 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufa3Q9CQ91 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufa3Q9CQ91 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufa3Q9CQ91 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufa3Q9CQ91 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufa3Q9CQ91 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufa3Q9CQ91 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufa3Q9CQ91 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufa3Q9CQ91 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufa3Q9CQ91 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufa3Q9CQ91 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufa3Q9CQ91 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufa3Q9CQ91 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufa3Q9CQ91 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufa3Q9CQ91 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufa3Q9CQ91 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms