Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chmp3Q9CQ10 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Chmp3Q9CQ10 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chmp3Q9CQ10 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chmp3Q9CQ10 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chmp3Q9CQ10 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chmp3Q9CQ10 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chmp3Q9CQ10 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chmp3Q9CQ10 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chmp3Q9CQ10 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chmp3Q9CQ10 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chmp3Q9CQ10 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chmp3Q9CQ10 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chmp3Q9CQ10 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chmp3Q9CQ10 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chmp3Q9CQ10 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chmp3Q9CQ10 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chmp3Q9CQ10 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chmp3Q9CQ10 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chmp3Q9CQ10 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chmp3Q9CQ10 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chmp3Q9CQ10 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chmp3Q9CQ10 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chmp3Q9CQ10 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chmp3Q9CQ10 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chmp3Q9CQ10 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chmp3Q9CQ10 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chmp3Q9CQ10 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chmp3Q9CQ10 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chmp3Q9CQ10 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chmp3Q9CQ10 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chmp3Q9CQ10 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chmp3Q9CQ10 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Chmp3Q9CQ10 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chmp3Q9CQ10 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chmp3Q9CQ10 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chmp3Q9CQ10 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chmp3Q9CQ10 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chmp3Q9CQ10 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chmp3Q9CQ10 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chmp3Q9CQ10 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chmp3Q9CQ10 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Chmp3Q9CQ10 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chmp3Q9CQ10 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chmp3Q9CQ10 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Chmp3Q9CQ10 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chmp3Q9CQ10 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chmp3Q9CQ10 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chmp3Q9CQ10 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chmp3Q9CQ10 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chmp3Q9CQ10 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chmp3Q9CQ10 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chmp3Q9CQ10 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chmp3Q9CQ10 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chmp3Q9CQ10 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Chmp3Q9CQ10 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chmp3Q9CQ10 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
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