Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Nup155Q99P88 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Nup155Q99P88 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Nup155Q99P88 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Nup155Q99P88 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Nup155Q99P88 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Nup155Q99P88 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Nup155Q99P88 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Nup155Q99P88 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Nup155Q99P88 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Nup155Q99P88 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Nup155Q99P88 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Nup155Q99P88 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Nup155Q99P88 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Nup155Q99P88 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Nup155Q99P88 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Nup155Q99P88 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Nup155Q99P88 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Nup155Q99P88 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Nup155Q99P88 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Nup155Q99P88 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Nup155Q99P88 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Nup155Q99P88 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Nup155Q99P88 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Nup155Q99P88 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Nup155Q99P88 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Nup155Q99P88 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Nup155Q99P88 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Nup155Q99P88 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Nup155Q99P88 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Nup155Q99P88 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Nup155Q99P88 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Nup155Q99P88 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Nup155Q99P88 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Nup155Q99P88 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Nup155Q99P88 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Nup155Q99P88 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Nup155Q99P88 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Nup155Q99P88 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Nup155Q99P88 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Nup155Q99P88 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Nup155Q99P88 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Nup155Q99P88 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Nup155Q99P88 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Nup155Q99P88 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Nup155Q99P88 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Nup155Q99P88 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Nup155Q99P88 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Nup155Q99P88 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Nup155Q99P88 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Nup155Q99P88 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Nup155Q99P88 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Nup155Q99P88 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Nup155Q99P88 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Nup155Q99P88 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Nup155Q99P88 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Nup155Q99P88 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Nup155Q99P88 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Nup155Q99P88 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Nup155Q99P88 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Nup155Q99P88 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Nup155Q99P88 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Nup155Q99P88 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Nup155Q99P88 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
Nup155Q99P88 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Nup155Q99P88 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Nup155Q99P88 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Nup155Q99P88 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
Nup155Q99P88 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Nup155Q99P88 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Nup155Q99P88 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Nup155Q99P88 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Nup155Q99P88 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Nup155Q99P88 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Nup155Q99P88 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Nup155Q99P88 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nup155Q99P88 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nup155Q99P88 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nup155Q99P88 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nup155Q99P88 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nup155Q99P88 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nup155Q99P88 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Nup155Q99P88 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Nup155Q99P88 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Nup155Q99P88 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Nup155Q99P88 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Nup155Q99P88 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Nup155Q99P88 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Nup155Q99P88 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Nup155Q99P88 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Nup155Q99P88 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Nup155Q99P88 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Nup155Q99P88 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Nup155Q99P88 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Nup155Q99P88 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Nup155Q99P88 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Nup155Q99P88 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Nup155Q99P88 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Nup155Q99P88 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Nup155Q99P88 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms