Protein–RNA interactions for Protein: Q99N16

Cyp4f3, Leukotriene-B(4) omega-hydroxylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f3Q99N16 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp4f3Q99N16 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp4f3Q99N16 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp4f3Q99N16 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp4f3Q99N16 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp4f3Q99N16 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp4f3Q99N16 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyp4f3Q99N16 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cyp4f3Q99N16 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cyp4f3Q99N16 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp4f3Q99N16 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp4f3Q99N16 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyp4f3Q99N16 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp4f3Q99N16 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp4f3Q99N16 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp4f3Q99N16 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp4f3Q99N16 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp4f3Q99N16 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp4f3Q99N16 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp4f3Q99N16 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp4f3Q99N16 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyp4f3Q99N16 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp4f3Q99N16 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp4f3Q99N16 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp4f3Q99N16 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp4f3Q99N16 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp4f3Q99N16 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp4f3Q99N16 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp4f3Q99N16 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp4f3Q99N16 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyp4f3Q99N16 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp4f3Q99N16 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp4f3Q99N16 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp4f3Q99N16 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp4f3Q99N16 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp4f3Q99N16 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp4f3Q99N16 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp4f3Q99N16 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp4f3Q99N16 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyp4f3Q99N16 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp4f3Q99N16 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp4f3Q99N16 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms