Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a6cQ99N08 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a6cQ99N08 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a6cQ99N08 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a6cQ99N08 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a6cQ99N08 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a6cQ99N08 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a6cQ99N08 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a6cQ99N08 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a6cQ99N08 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a6cQ99N08 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a6cQ99N08 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a6cQ99N08 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a6cQ99N08 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a6cQ99N08 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a6cQ99N08 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a6cQ99N08 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a6cQ99N08 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a6cQ99N08 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a6cQ99N08 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a6cQ99N08 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a6cQ99N08 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a6cQ99N08 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a6cQ99N08 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a6cQ99N08 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a6cQ99N08 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a6cQ99N08 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a6cQ99N08 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a6cQ99N08 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a6cQ99N08 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a6cQ99N08 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a6cQ99N08 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a6cQ99N08 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a6cQ99N08 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a6cQ99N08 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a6cQ99N08 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a6cQ99N08 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a6cQ99N08 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a6cQ99N08 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a6cQ99N08 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms