Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnpo2Q99LG2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnpo2Q99LG2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnpo2Q99LG2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnpo2Q99LG2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnpo2Q99LG2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnpo2Q99LG2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnpo2Q99LG2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnpo2Q99LG2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnpo2Q99LG2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnpo2Q99LG2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnpo2Q99LG2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnpo2Q99LG2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnpo2Q99LG2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnpo2Q99LG2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnpo2Q99LG2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnpo2Q99LG2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnpo2Q99LG2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnpo2Q99LG2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnpo2Q99LG2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnpo2Q99LG2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnpo2Q99LG2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnpo2Q99LG2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnpo2Q99LG2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnpo2Q99LG2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnpo2Q99LG2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnpo2Q99LG2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnpo2Q99LG2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnpo2Q99LG2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnpo2Q99LG2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnpo2Q99LG2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnpo2Q99LG2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnpo2Q99LG2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnpo2Q99LG2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnpo2Q99LG2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnpo2Q99LG2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnpo2Q99LG2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnpo2Q99LG2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnpo2Q99LG2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnpo2Q99LG2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnpo2Q99LG2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnpo2Q99LG2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnpo2Q99LG2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnpo2Q99LG2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnpo2Q99LG2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms