Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nmd3Q99L48 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nmd3Q99L48 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nmd3Q99L48 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nmd3Q99L48 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nmd3Q99L48 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nmd3Q99L48 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nmd3Q99L48 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nmd3Q99L48 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nmd3Q99L48 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nmd3Q99L48 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nmd3Q99L48 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nmd3Q99L48 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nmd3Q99L48 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nmd3Q99L48 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nmd3Q99L48 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nmd3Q99L48 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nmd3Q99L48 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nmd3Q99L48 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nmd3Q99L48 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nmd3Q99L48 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nmd3Q99L48 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nmd3Q99L48 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nmd3Q99L48 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nmd3Q99L48 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nmd3Q99L48 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nmd3Q99L48 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nmd3Q99L48 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nmd3Q99L48 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nmd3Q99L48 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nmd3Q99L48 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nmd3Q99L48 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nmd3Q99L48 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nmd3Q99L48 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nmd3Q99L48 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nmd3Q99L48 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nmd3Q99L48 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nmd3Q99L48 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nmd3Q99L48 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nmd3Q99L48 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Nmd3Q99L48 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nmd3Q99L48 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nmd3Q99L48 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nmd3Q99L48 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nmd3Q99L48 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nmd3Q99L48 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nmd3Q99L48 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nmd3Q99L48 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nmd3Q99L48 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nmd3Q99L48 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nmd3Q99L48 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nmd3Q99L48 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nmd3Q99L48 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Nmd3Q99L48 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nmd3Q99L48 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nmd3Q99L48 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nmd3Q99L48 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nmd3Q99L48 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms