Protein–RNA interactions for Protein: Q99KV1

Dnajb11, DnaJ homolog subfamily B member 11, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb11Q99KV1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnajb11Q99KV1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dnajb11Q99KV1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dnajb11Q99KV1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Dnajb11Q99KV1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dnajb11Q99KV1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dnajb11Q99KV1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dnajb11Q99KV1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dnajb11Q99KV1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnajb11Q99KV1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnajb11Q99KV1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnajb11Q99KV1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnajb11Q99KV1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms