Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ubxn2aQ99KJ0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ubxn2aQ99KJ0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubxn2aQ99KJ0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubxn2aQ99KJ0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubxn2aQ99KJ0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubxn2aQ99KJ0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubxn2aQ99KJ0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubxn2aQ99KJ0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubxn2aQ99KJ0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubxn2aQ99KJ0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubxn2aQ99KJ0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ubxn2aQ99KJ0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ubxn2aQ99KJ0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn2aQ99KJ0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn2aQ99KJ0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn2aQ99KJ0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn2aQ99KJ0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn2aQ99KJ0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn2aQ99KJ0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubxn2aQ99KJ0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubxn2aQ99KJ0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubxn2aQ99KJ0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubxn2aQ99KJ0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubxn2aQ99KJ0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubxn2aQ99KJ0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubxn2aQ99KJ0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubxn2aQ99KJ0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubxn2aQ99KJ0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubxn2aQ99KJ0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubxn2aQ99KJ0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubxn2aQ99KJ0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubxn2aQ99KJ0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubxn2aQ99KJ0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubxn2aQ99KJ0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubxn2aQ99KJ0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubxn2aQ99KJ0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubxn2aQ99KJ0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubxn2aQ99KJ0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ubxn2aQ99KJ0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ubxn2aQ99KJ0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ubxn2aQ99KJ0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubxn2aQ99KJ0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubxn2aQ99KJ0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubxn2aQ99KJ0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubxn2aQ99KJ0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubxn2aQ99KJ0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubxn2aQ99KJ0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubxn2aQ99KJ0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubxn2aQ99KJ0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubxn2aQ99KJ0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubxn2aQ99KJ0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubxn2aQ99KJ0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubxn2aQ99KJ0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubxn2aQ99KJ0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubxn2aQ99KJ0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubxn2aQ99KJ0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubxn2aQ99KJ0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubxn2aQ99KJ0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubxn2aQ99KJ0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubxn2aQ99KJ0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubxn2aQ99KJ0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubxn2aQ99KJ0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubxn2aQ99KJ0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ubxn2aQ99KJ0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ubxn2aQ99KJ0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubxn2aQ99KJ0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubxn2aQ99KJ0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubxn2aQ99KJ0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ubxn2aQ99KJ0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ubxn2aQ99KJ0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ubxn2aQ99KJ0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ubxn2aQ99KJ0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubxn2aQ99KJ0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubxn2aQ99KJ0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubxn2aQ99KJ0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubxn2aQ99KJ0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ubxn2aQ99KJ0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubxn2aQ99KJ0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubxn2aQ99KJ0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubxn2aQ99KJ0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ubxn2aQ99KJ0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ubxn2aQ99KJ0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ubxn2aQ99KJ0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ubxn2aQ99KJ0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ubxn2aQ99KJ0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ubxn2aQ99KJ0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ubxn2aQ99KJ0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubxn2aQ99KJ0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms