Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH7

Clstn3, Calsyntenin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3Q99JH7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clstn3Q99JH7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clstn3Q99JH7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Clstn3Q99JH7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clstn3Q99JH7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clstn3Q99JH7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clstn3Q99JH7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clstn3Q99JH7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clstn3Q99JH7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clstn3Q99JH7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clstn3Q99JH7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clstn3Q99JH7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clstn3Q99JH7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clstn3Q99JH7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clstn3Q99JH7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Clstn3Q99JH7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clstn3Q99JH7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clstn3Q99JH7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clstn3Q99JH7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clstn3Q99JH7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Clstn3Q99JH7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Clstn3Q99JH7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clstn3Q99JH7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clstn3Q99JH7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clstn3Q99JH7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clstn3Q99JH7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Clstn3Q99JH7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clstn3Q99JH7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clstn3Q99JH7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clstn3Q99JH7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clstn3Q99JH7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clstn3Q99JH7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clstn3Q99JH7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Clstn3Q99JH7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clstn3Q99JH7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clstn3Q99JH7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clstn3Q99JH7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clstn3Q99JH7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clstn3Q99JH7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clstn3Q99JH7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clstn3Q99JH7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clstn3Q99JH7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clstn3Q99JH7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Clstn3Q99JH7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clstn3Q99JH7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clstn3Q99JH7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clstn3Q99JH7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clstn3Q99JH7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clstn3Q99JH7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clstn3Q99JH7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clstn3Q99JH7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clstn3Q99JH7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn3Q99JH7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn3Q99JH7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn3Q99JH7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn3Q99JH7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn3Q99JH7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn3Q99JH7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn3Q99JH7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clstn3Q99JH7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clstn3Q99JH7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clstn3Q99JH7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clstn3Q99JH7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clstn3Q99JH7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clstn3Q99JH7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clstn3Q99JH7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clstn3Q99JH7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clstn3Q99JH7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clstn3Q99JH7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clstn3Q99JH7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clstn3Q99JH7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clstn3Q99JH7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clstn3Q99JH7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clstn3Q99JH7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clstn3Q99JH7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clstn3Q99JH7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clstn3Q99JH7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clstn3Q99JH7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Clstn3Q99JH7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Clstn3Q99JH7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clstn3Q99JH7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clstn3Q99JH7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clstn3Q99JH7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clstn3Q99JH7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Clstn3Q99JH7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clstn3Q99JH7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clstn3Q99JH7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clstn3Q99JH7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clstn3Q99JH7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clstn3Q99JH7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clstn3Q99JH7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clstn3Q99JH7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clstn3Q99JH7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clstn3Q99JH7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clstn3Q99JH7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clstn3Q99JH7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clstn3Q99JH7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clstn3Q99JH7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clstn3Q99JH7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clstn3Q99JH7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms