Protein–RNA interactions for Protein: Q99J38

Ttc30a1, Tetratricopeptide repeat protein 30A1, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc30a1Q99J38 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Ttc30a1Q99J38 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc30a1Q99J38 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc30a1Q99J38 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc30a1Q99J38 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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Ttc30a1Q99J38 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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Ttc30a1Q99J38 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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Ttc30a1Q99J38 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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Ttc30a1Q99J38 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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Ttc30a1Q99J38 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttc30a1Q99J38 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc30a1Q99J38 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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Ttc30a1Q99J38 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ttc30a1Q99J38 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ttc30a1Q99J38 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc30a1Q99J38 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc30a1Q99J38 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc30a1Q99J38 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc30a1Q99J38 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc30a1Q99J38 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc30a1Q99J38 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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Ttc30a1Q99J38 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc30a1Q99J38 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc30a1Q99J38 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Ttc30a1Q99J38 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc30a1Q99J38 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Ttc30a1Q99J38 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc30a1Q99J38 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc30a1Q99J38 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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