Protein–RNA interactions for Protein: Q925N1

Sfxn4, Sideroflexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn4Q925N1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sfxn4Q925N1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sfxn4Q925N1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms