Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csmd1Q923L3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csmd1Q923L3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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