Protein–RNA interactions for Protein: Q920N2

Hlcs, Biotin--protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HlcsQ920N2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HlcsQ920N2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HlcsQ920N2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HlcsQ920N2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HlcsQ920N2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HlcsQ920N2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HlcsQ920N2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HlcsQ920N2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HlcsQ920N2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HlcsQ920N2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HlcsQ920N2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HlcsQ920N2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HlcsQ920N2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HlcsQ920N2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HlcsQ920N2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HlcsQ920N2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HlcsQ920N2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HlcsQ920N2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HlcsQ920N2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HlcsQ920N2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HlcsQ920N2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HlcsQ920N2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HlcsQ920N2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HlcsQ920N2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HlcsQ920N2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HlcsQ920N2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HlcsQ920N2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HlcsQ920N2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HlcsQ920N2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HlcsQ920N2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HlcsQ920N2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HlcsQ920N2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HlcsQ920N2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HlcsQ920N2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HlcsQ920N2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HlcsQ920N2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HlcsQ920N2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HlcsQ920N2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HlcsQ920N2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HlcsQ920N2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HlcsQ920N2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HlcsQ920N2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HlcsQ920N2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HlcsQ920N2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HlcsQ920N2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HlcsQ920N2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HlcsQ920N2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HlcsQ920N2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HlcsQ920N2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HlcsQ920N2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HlcsQ920N2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HlcsQ920N2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HlcsQ920N2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HlcsQ920N2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HlcsQ920N2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HlcsQ920N2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HlcsQ920N2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HlcsQ920N2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HlcsQ920N2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HlcsQ920N2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HlcsQ920N2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HlcsQ920N2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HlcsQ920N2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HlcsQ920N2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HlcsQ920N2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HlcsQ920N2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HlcsQ920N2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HlcsQ920N2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HlcsQ920N2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HlcsQ920N2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HlcsQ920N2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HlcsQ920N2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HlcsQ920N2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HlcsQ920N2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HlcsQ920N2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HlcsQ920N2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HlcsQ920N2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HlcsQ920N2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HlcsQ920N2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HlcsQ920N2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HlcsQ920N2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HlcsQ920N2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HlcsQ920N2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HlcsQ920N2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HlcsQ920N2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HlcsQ920N2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HlcsQ920N2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HlcsQ920N2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HlcsQ920N2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HlcsQ920N2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HlcsQ920N2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HlcsQ920N2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HlcsQ920N2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HlcsQ920N2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HlcsQ920N2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HlcsQ920N2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HlcsQ920N2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HlcsQ920N2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HlcsQ920N2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HlcsQ920N2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms