Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde6cQ91ZQ1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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Pde6cQ91ZQ1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde6cQ91ZQ1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde6cQ91ZQ1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
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