Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc49Q91YK0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc49Q91YK0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms