Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Trpm2Q91YD4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Trpm2Q91YD4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Trpm2Q91YD4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Trpm2Q91YD4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Trpm2Q91YD4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Trpm2Q91YD4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Trpm2Q91YD4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Trpm2Q91YD4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Trpm2Q91YD4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Trpm2Q91YD4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Trpm2Q91YD4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Trpm2Q91YD4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Trpm2Q91YD4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Trpm2Q91YD4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Trpm2Q91YD4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Trpm2Q91YD4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Trpm2Q91YD4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Trpm2Q91YD4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Trpm2Q91YD4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Trpm2Q91YD4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Trpm2Q91YD4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Trpm2Q91YD4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Trpm2Q91YD4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Trpm2Q91YD4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Trpm2Q91YD4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Trpm2Q91YD4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Trpm2Q91YD4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Trpm2Q91YD4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Trpm2Q91YD4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Trpm2Q91YD4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Trpm2Q91YD4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Trpm2Q91YD4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Trpm2Q91YD4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Trpm2Q91YD4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
Trpm2Q91YD4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Trpm2Q91YD4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Trpm2Q91YD4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Trpm2Q91YD4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Trpm2Q91YD4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Trpm2Q91YD4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Trpm2Q91YD4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Trpm2Q91YD4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Trpm2Q91YD4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Trpm2Q91YD4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Trpm2Q91YD4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Trpm2Q91YD4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Trpm2Q91YD4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Trpm2Q91YD4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Trpm2Q91YD4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Trpm2Q91YD4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Trpm2Q91YD4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Trpm2Q91YD4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Trpm2Q91YD4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Trpm2Q91YD4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Trpm2Q91YD4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Trpm2Q91YD4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Trpm2Q91YD4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Trpm2Q91YD4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Trpm2Q91YD4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Trpm2Q91YD4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Trpm2Q91YD4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Trpm2Q91YD4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Trpm2Q91YD4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Trpm2Q91YD4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Trpm2Q91YD4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Trpm2Q91YD4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Trpm2Q91YD4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Trpm2Q91YD4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
Trpm2Q91YD4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
Trpm2Q91YD4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Trpm2Q91YD4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Trpm2Q91YD4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Trpm2Q91YD4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Trpm2Q91YD4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Trpm2Q91YD4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Trpm2Q91YD4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Trpm2Q91YD4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Trpm2Q91YD4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Trpm2Q91YD4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Trpm2Q91YD4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Trpm2Q91YD4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Trpm2Q91YD4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Trpm2Q91YD4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Trpm2Q91YD4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Trpm2Q91YD4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Trpm2Q91YD4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Trpm2Q91YD4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Trpm2Q91YD4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.61
Trpm2Q91YD4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Trpm2Q91YD4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Trpm2Q91YD4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Trpm2Q91YD4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Trpm2Q91YD4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Trpm2Q91YD4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Trpm2Q91YD4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Trpm2Q91YD4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Trpm2Q91YD4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Trpm2Q91YD4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Trpm2Q91YD4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 197.4 ms