Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Creb3l3Q91XE9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Creb3l3Q91XE9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Creb3l3Q91XE9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Creb3l3Q91XE9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Creb3l3Q91XE9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Creb3l3Q91XE9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Creb3l3Q91XE9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Creb3l3Q91XE9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Creb3l3Q91XE9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Creb3l3Q91XE9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Creb3l3Q91XE9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Creb3l3Q91XE9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Creb3l3Q91XE9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Creb3l3Q91XE9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Creb3l3Q91XE9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Creb3l3Q91XE9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Creb3l3Q91XE9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Creb3l3Q91XE9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Creb3l3Q91XE9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Creb3l3Q91XE9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Creb3l3Q91XE9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Creb3l3Q91XE9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Creb3l3Q91XE9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Creb3l3Q91XE9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Creb3l3Q91XE9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Creb3l3Q91XE9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Creb3l3Q91XE9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Creb3l3Q91XE9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Creb3l3Q91XE9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Creb3l3Q91XE9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Creb3l3Q91XE9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Creb3l3Q91XE9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Creb3l3Q91XE9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Creb3l3Q91XE9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Creb3l3Q91XE9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Creb3l3Q91XE9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Creb3l3Q91XE9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Creb3l3Q91XE9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Creb3l3Q91XE9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Creb3l3Q91XE9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Creb3l3Q91XE9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Creb3l3Q91XE9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Creb3l3Q91XE9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Creb3l3Q91XE9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Creb3l3Q91XE9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Creb3l3Q91XE9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Creb3l3Q91XE9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Creb3l3Q91XE9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Creb3l3Q91XE9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Creb3l3Q91XE9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Creb3l3Q91XE9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Creb3l3Q91XE9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Creb3l3Q91XE9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Creb3l3Q91XE9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Creb3l3Q91XE9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Creb3l3Q91XE9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Creb3l3Q91XE9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Creb3l3Q91XE9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Creb3l3Q91XE9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Creb3l3Q91XE9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Creb3l3Q91XE9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Creb3l3Q91XE9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Creb3l3Q91XE9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Creb3l3Q91XE9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Creb3l3Q91XE9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Creb3l3Q91XE9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Creb3l3Q91XE9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Creb3l3Q91XE9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Creb3l3Q91XE9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Creb3l3Q91XE9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Creb3l3Q91XE9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Creb3l3Q91XE9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Creb3l3Q91XE9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Creb3l3Q91XE9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Creb3l3Q91XE9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Creb3l3Q91XE9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Creb3l3Q91XE9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Creb3l3Q91XE9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Creb3l3Q91XE9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Creb3l3Q91XE9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Creb3l3Q91XE9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Creb3l3Q91XE9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Creb3l3Q91XE9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Creb3l3Q91XE9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Creb3l3Q91XE9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Creb3l3Q91XE9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Creb3l3Q91XE9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Creb3l3Q91XE9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Creb3l3Q91XE9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Creb3l3Q91XE9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Creb3l3Q91XE9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Creb3l3Q91XE9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Creb3l3Q91XE9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Creb3l3Q91XE9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Creb3l3Q91XE9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Creb3l3Q91XE9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Creb3l3Q91XE9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Creb3l3Q91XE9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Creb3l3Q91XE9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms