Protein–RNA interactions for Protein: Q91X93

Prb1, Proline-rich protein BstNI subfamily 1, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prb1Q91X93 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prb1Q91X93 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prb1Q91X93 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prb1Q91X93 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prb1Q91X93 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prb1Q91X93 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prb1Q91X93 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prb1Q91X93 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prb1Q91X93 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prb1Q91X93 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prb1Q91X93 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prb1Q91X93 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prb1Q91X93 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prb1Q91X93 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prb1Q91X93 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prb1Q91X93 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prb1Q91X93 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prb1Q91X93 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prb1Q91X93 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prb1Q91X93 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prb1Q91X93 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prb1Q91X93 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prb1Q91X93 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prb1Q91X93 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prb1Q91X93 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prb1Q91X93 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prb1Q91X93 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prb1Q91X93 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Prb1Q91X93 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prb1Q91X93 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prb1Q91X93 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prb1Q91X93 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prb1Q91X93 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prb1Q91X93 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prb1Q91X93 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Prb1Q91X93 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prb1Q91X93 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Prb1Q91X93 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prb1Q91X93 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prb1Q91X93 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prb1Q91X93 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Prb1Q91X93 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prb1Q91X93 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prb1Q91X93 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prb1Q91X93 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prb1Q91X93 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prb1Q91X93 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Prb1Q91X93 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prb1Q91X93 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prb1Q91X93 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prb1Q91X93 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prb1Q91X93 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prb1Q91X93 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prb1Q91X93 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Prb1Q91X93 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Prb1Q91X93 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Prb1Q91X93 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prb1Q91X93 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prb1Q91X93 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prb1Q91X93 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prb1Q91X93 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prb1Q91X93 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prb1Q91X93 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prb1Q91X93 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prb1Q91X93 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prb1Q91X93 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prb1Q91X93 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prb1Q91X93 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prb1Q91X93 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms