Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp3Q91W36 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp3Q91W36 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp3Q91W36 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp3Q91W36 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp3Q91W36 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp3Q91W36 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp3Q91W36 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp3Q91W36 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp3Q91W36 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp3Q91W36 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp3Q91W36 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp3Q91W36 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp3Q91W36 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp3Q91W36 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp3Q91W36 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp3Q91W36 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp3Q91W36 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp3Q91W36 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp3Q91W36 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp3Q91W36 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp3Q91W36 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp3Q91W36 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp3Q91W36 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp3Q91W36 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp3Q91W36 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp3Q91W36 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp3Q91W36 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp3Q91W36 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp3Q91W36 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp3Q91W36 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp3Q91W36 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp3Q91W36 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp3Q91W36 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp3Q91W36 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp3Q91W36 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp3Q91W36 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp3Q91W36 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp3Q91W36 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp3Q91W36 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp3Q91W36 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp3Q91W36 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp3Q91W36 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp3Q91W36 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp3Q91W36 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp3Q91W36 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp3Q91W36 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp3Q91W36 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp3Q91W36 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp3Q91W36 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp3Q91W36 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp3Q91W36 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp3Q91W36 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp3Q91W36 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp3Q91W36 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp3Q91W36 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp3Q91W36 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp3Q91W36 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp3Q91W36 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp3Q91W36 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp3Q91W36 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp3Q91W36 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms