Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIG6

Traip, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraipQ8VIG6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TraipQ8VIG6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TraipQ8VIG6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TraipQ8VIG6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TraipQ8VIG6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TraipQ8VIG6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TraipQ8VIG6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TraipQ8VIG6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TraipQ8VIG6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TraipQ8VIG6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TraipQ8VIG6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TraipQ8VIG6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TraipQ8VIG6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TraipQ8VIG6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TraipQ8VIG6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TraipQ8VIG6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TraipQ8VIG6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TraipQ8VIG6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TraipQ8VIG6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TraipQ8VIG6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TraipQ8VIG6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TraipQ8VIG6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TraipQ8VIG6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TraipQ8VIG6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TraipQ8VIG6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TraipQ8VIG6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TraipQ8VIG6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TraipQ8VIG6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TraipQ8VIG6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TraipQ8VIG6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TraipQ8VIG6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TraipQ8VIG6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TraipQ8VIG6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TraipQ8VIG6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TraipQ8VIG6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TraipQ8VIG6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TraipQ8VIG6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TraipQ8VIG6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TraipQ8VIG6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TraipQ8VIG6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TraipQ8VIG6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TraipQ8VIG6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TraipQ8VIG6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TraipQ8VIG6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TraipQ8VIG6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TraipQ8VIG6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TraipQ8VIG6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TraipQ8VIG6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TraipQ8VIG6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TraipQ8VIG6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TraipQ8VIG6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TraipQ8VIG6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TraipQ8VIG6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TraipQ8VIG6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TraipQ8VIG6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TraipQ8VIG6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TraipQ8VIG6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TraipQ8VIG6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TraipQ8VIG6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TraipQ8VIG6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TraipQ8VIG6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TraipQ8VIG6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TraipQ8VIG6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TraipQ8VIG6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TraipQ8VIG6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TraipQ8VIG6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TraipQ8VIG6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TraipQ8VIG6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TraipQ8VIG6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TraipQ8VIG6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TraipQ8VIG6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TraipQ8VIG6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TraipQ8VIG6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TraipQ8VIG6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TraipQ8VIG6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TraipQ8VIG6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TraipQ8VIG6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TraipQ8VIG6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TraipQ8VIG6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TraipQ8VIG6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TraipQ8VIG6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TraipQ8VIG6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TraipQ8VIG6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TraipQ8VIG6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TraipQ8VIG6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TraipQ8VIG6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TraipQ8VIG6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TraipQ8VIG6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TraipQ8VIG6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TraipQ8VIG6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TraipQ8VIG6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TraipQ8VIG6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TraipQ8VIG6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TraipQ8VIG6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TraipQ8VIG6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TraipQ8VIG6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TraipQ8VIG6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TraipQ8VIG6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TraipQ8VIG6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TraipQ8VIG6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms