Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnajc28Q8VCE1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnajc28Q8VCE1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnajc28Q8VCE1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnajc28Q8VCE1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnajc28Q8VCE1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnajc28Q8VCE1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnajc28Q8VCE1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnajc28Q8VCE1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnajc28Q8VCE1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnajc28Q8VCE1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnajc28Q8VCE1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnajc28Q8VCE1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnajc28Q8VCE1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnajc28Q8VCE1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnajc28Q8VCE1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnajc28Q8VCE1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnajc28Q8VCE1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnajc28Q8VCE1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnajc28Q8VCE1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnajc28Q8VCE1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnajc28Q8VCE1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnajc28Q8VCE1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dnajc28Q8VCE1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dnajc28Q8VCE1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dnajc28Q8VCE1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dnajc28Q8VCE1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dnajc28Q8VCE1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnajc28Q8VCE1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnajc28Q8VCE1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnajc28Q8VCE1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnajc28Q8VCE1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnajc28Q8VCE1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnajc28Q8VCE1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnajc28Q8VCE1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnajc28Q8VCE1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnajc28Q8VCE1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnajc28Q8VCE1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnajc28Q8VCE1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnajc28Q8VCE1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnajc28Q8VCE1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnajc28Q8VCE1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnajc28Q8VCE1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnajc28Q8VCE1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnajc28Q8VCE1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnajc28Q8VCE1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnajc28Q8VCE1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dnajc28Q8VCE1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dnajc28Q8VCE1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dnajc28Q8VCE1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dnajc28Q8VCE1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dnajc28Q8VCE1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms