Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Med17Q8VCD5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Med17Q8VCD5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Med17Q8VCD5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Med17Q8VCD5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Med17Q8VCD5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Med17Q8VCD5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Med17Q8VCD5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Med17Q8VCD5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Med17Q8VCD5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Med17Q8VCD5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med17Q8VCD5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med17Q8VCD5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med17Q8VCD5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med17Q8VCD5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med17Q8VCD5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med17Q8VCD5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med17Q8VCD5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Med17Q8VCD5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med17Q8VCD5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med17Q8VCD5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med17Q8VCD5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med17Q8VCD5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med17Q8VCD5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med17Q8VCD5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med17Q8VCD5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med17Q8VCD5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med17Q8VCD5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med17Q8VCD5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med17Q8VCD5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med17Q8VCD5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med17Q8VCD5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med17Q8VCD5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Med17Q8VCD5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Med17Q8VCD5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Med17Q8VCD5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Med17Q8VCD5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Med17Q8VCD5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Med17Q8VCD5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Med17Q8VCD5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Med17Q8VCD5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Med17Q8VCD5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Med17Q8VCD5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Med17Q8VCD5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Med17Q8VCD5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Med17Q8VCD5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Med17Q8VCD5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms