Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rapgef3Q8VCC8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rapgef3Q8VCC8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rapgef3Q8VCC8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rapgef3Q8VCC8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Rapgef3Q8VCC8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rapgef3Q8VCC8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rapgef3Q8VCC8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rapgef3Q8VCC8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rapgef3Q8VCC8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rapgef3Q8VCC8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rapgef3Q8VCC8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rapgef3Q8VCC8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rapgef3Q8VCC8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rapgef3Q8VCC8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rapgef3Q8VCC8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rapgef3Q8VCC8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Rapgef3Q8VCC8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rapgef3Q8VCC8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rapgef3Q8VCC8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rapgef3Q8VCC8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rapgef3Q8VCC8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rapgef3Q8VCC8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rapgef3Q8VCC8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rapgef3Q8VCC8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rapgef3Q8VCC8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rapgef3Q8VCC8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rapgef3Q8VCC8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rapgef3Q8VCC8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rapgef3Q8VCC8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rapgef3Q8VCC8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rapgef3Q8VCC8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rapgef3Q8VCC8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rapgef3Q8VCC8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rapgef3Q8VCC8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rapgef3Q8VCC8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rapgef3Q8VCC8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rapgef3Q8VCC8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rapgef3Q8VCC8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rapgef3Q8VCC8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rapgef3Q8VCC8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Rapgef3Q8VCC8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rapgef3Q8VCC8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Rapgef3Q8VCC8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rapgef3Q8VCC8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Rapgef3Q8VCC8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rapgef3Q8VCC8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rapgef3Q8VCC8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Rapgef3Q8VCC8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rapgef3Q8VCC8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rapgef3Q8VCC8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rapgef3Q8VCC8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rapgef3Q8VCC8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rapgef3Q8VCC8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rapgef3Q8VCC8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rapgef3Q8VCC8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Rapgef3Q8VCC8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rapgef3Q8VCC8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rapgef3Q8VCC8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rapgef3Q8VCC8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rapgef3Q8VCC8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rapgef3Q8VCC8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rapgef3Q8VCC8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rapgef3Q8VCC8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rapgef3Q8VCC8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rapgef3Q8VCC8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rapgef3Q8VCC8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Rapgef3Q8VCC8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Rapgef3Q8VCC8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rapgef3Q8VCC8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rapgef3Q8VCC8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rapgef3Q8VCC8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rapgef3Q8VCC8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rapgef3Q8VCC8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rapgef3Q8VCC8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rapgef3Q8VCC8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rapgef3Q8VCC8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rapgef3Q8VCC8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rapgef3Q8VCC8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Rapgef3Q8VCC8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rapgef3Q8VCC8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rapgef3Q8VCC8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rapgef3Q8VCC8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rapgef3Q8VCC8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rapgef3Q8VCC8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rapgef3Q8VCC8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rapgef3Q8VCC8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rapgef3Q8VCC8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rapgef3Q8VCC8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rapgef3Q8VCC8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rapgef3Q8VCC8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Rapgef3Q8VCC8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Rapgef3Q8VCC8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rapgef3Q8VCC8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Rapgef3Q8VCC8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rapgef3Q8VCC8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rapgef3Q8VCC8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rapgef3Q8VCC8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rapgef3Q8VCC8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rapgef3Q8VCC8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
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