Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc9Q8VC31 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc9Q8VC31 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc9Q8VC31 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc9Q8VC31 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc9Q8VC31 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc9Q8VC31 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc9Q8VC31 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc9Q8VC31 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc9Q8VC31 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc9Q8VC31 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc9Q8VC31 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc9Q8VC31 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc9Q8VC31 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc9Q8VC31 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc9Q8VC31 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc9Q8VC31 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc9Q8VC31 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc9Q8VC31 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc9Q8VC31 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc9Q8VC31 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc9Q8VC31 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc9Q8VC31 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc9Q8VC31 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc9Q8VC31 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc9Q8VC31 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc9Q8VC31 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc9Q8VC31 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc9Q8VC31 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc9Q8VC31 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc9Q8VC31 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc9Q8VC31 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc9Q8VC31 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc9Q8VC31 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc9Q8VC31 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc9Q8VC31 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc9Q8VC31 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc9Q8VC31 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc9Q8VC31 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc9Q8VC31 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc9Q8VC31 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc9Q8VC31 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc9Q8VC31 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc9Q8VC31 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc9Q8VC31 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc9Q8VC31 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc9Q8VC31 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc9Q8VC31 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc9Q8VC31 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc9Q8VC31 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc9Q8VC31 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc9Q8VC31 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc9Q8VC31 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc9Q8VC31 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc9Q8VC31 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc9Q8VC31 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc9Q8VC31 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc9Q8VC31 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc9Q8VC31 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc9Q8VC31 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc9Q8VC31 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc9Q8VC31 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc9Q8VC31 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc9Q8VC31 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc9Q8VC31 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc9Q8VC31 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc9Q8VC31 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc9Q8VC31 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc9Q8VC31 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc9Q8VC31 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc9Q8VC31 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms