Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slf1Q8R3P9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slf1Q8R3P9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slf1Q8R3P9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slf1Q8R3P9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slf1Q8R3P9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slf1Q8R3P9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Slf1Q8R3P9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slf1Q8R3P9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slf1Q8R3P9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slf1Q8R3P9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slf1Q8R3P9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slf1Q8R3P9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slf1Q8R3P9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slf1Q8R3P9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slf1Q8R3P9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slf1Q8R3P9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slf1Q8R3P9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slf1Q8R3P9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slf1Q8R3P9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slf1Q8R3P9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slf1Q8R3P9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slf1Q8R3P9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Slf1Q8R3P9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slf1Q8R3P9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slf1Q8R3P9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slf1Q8R3P9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slf1Q8R3P9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slf1Q8R3P9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slf1Q8R3P9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slf1Q8R3P9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slf1Q8R3P9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slf1Q8R3P9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slf1Q8R3P9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slf1Q8R3P9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slf1Q8R3P9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slf1Q8R3P9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slf1Q8R3P9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slf1Q8R3P9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slf1Q8R3P9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slf1Q8R3P9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slf1Q8R3P9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slf1Q8R3P9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slf1Q8R3P9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slf1Q8R3P9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Slf1Q8R3P9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slf1Q8R3P9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slf1Q8R3P9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Slf1Q8R3P9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slf1Q8R3P9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slf1Q8R3P9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slf1Q8R3P9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slf1Q8R3P9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slf1Q8R3P9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slf1Q8R3P9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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