Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab11fip5Q8R361 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab11fip5Q8R361 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms