Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pitrm1Q8K411 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pitrm1Q8K411 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pitrm1Q8K411 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pitrm1Q8K411 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pitrm1Q8K411 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pitrm1Q8K411 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pitrm1Q8K411 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pitrm1Q8K411 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pitrm1Q8K411 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pitrm1Q8K411 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pitrm1Q8K411 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pitrm1Q8K411 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms