Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nsl1Q8K305 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nsl1Q8K305 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nsl1Q8K305 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nsl1Q8K305 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nsl1Q8K305 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nsl1Q8K305 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nsl1Q8K305 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nsl1Q8K305 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nsl1Q8K305 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nsl1Q8K305 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nsl1Q8K305 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Nsl1Q8K305 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nsl1Q8K305 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Nsl1Q8K305 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nsl1Q8K305 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nsl1Q8K305 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nsl1Q8K305 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nsl1Q8K305 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nsl1Q8K305 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Nsl1Q8K305 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nsl1Q8K305 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nsl1Q8K305 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nsl1Q8K305 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nsl1Q8K305 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nsl1Q8K305 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nsl1Q8K305 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nsl1Q8K305 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nsl1Q8K305 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nsl1Q8K305 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nsl1Q8K305 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nsl1Q8K305 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nsl1Q8K305 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nsl1Q8K305 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nsl1Q8K305 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nsl1Q8K305 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nsl1Q8K305 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Nsl1Q8K305 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nsl1Q8K305 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nsl1Q8K305 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nsl1Q8K305 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nsl1Q8K305 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nsl1Q8K305 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nsl1Q8K305 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nsl1Q8K305 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nsl1Q8K305 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms