Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Otud6bQ8K2H2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Otud6bQ8K2H2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Otud6bQ8K2H2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Otud6bQ8K2H2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Otud6bQ8K2H2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Otud6bQ8K2H2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Otud6bQ8K2H2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Otud6bQ8K2H2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Otud6bQ8K2H2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Otud6bQ8K2H2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Otud6bQ8K2H2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Otud6bQ8K2H2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Otud6bQ8K2H2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Otud6bQ8K2H2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Otud6bQ8K2H2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Otud6bQ8K2H2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Otud6bQ8K2H2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Otud6bQ8K2H2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Otud6bQ8K2H2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Otud6bQ8K2H2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Otud6bQ8K2H2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Otud6bQ8K2H2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Otud6bQ8K2H2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Otud6bQ8K2H2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Otud6bQ8K2H2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Otud6bQ8K2H2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Otud6bQ8K2H2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Otud6bQ8K2H2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Otud6bQ8K2H2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms