Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FgbQ8K0E8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FgbQ8K0E8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FgbQ8K0E8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FgbQ8K0E8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FgbQ8K0E8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FgbQ8K0E8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FgbQ8K0E8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FgbQ8K0E8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FgbQ8K0E8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FgbQ8K0E8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FgbQ8K0E8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FgbQ8K0E8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FgbQ8K0E8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FgbQ8K0E8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FgbQ8K0E8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FgbQ8K0E8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FgbQ8K0E8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FgbQ8K0E8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FgbQ8K0E8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FgbQ8K0E8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FgbQ8K0E8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FgbQ8K0E8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FgbQ8K0E8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FgbQ8K0E8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FgbQ8K0E8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FgbQ8K0E8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FgbQ8K0E8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FgbQ8K0E8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FgbQ8K0E8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FgbQ8K0E8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FgbQ8K0E8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FgbQ8K0E8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FgbQ8K0E8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FgbQ8K0E8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FgbQ8K0E8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FgbQ8K0E8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FgbQ8K0E8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FgbQ8K0E8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FgbQ8K0E8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FgbQ8K0E8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FgbQ8K0E8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FgbQ8K0E8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FgbQ8K0E8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FgbQ8K0E8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FgbQ8K0E8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FgbQ8K0E8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FgbQ8K0E8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FgbQ8K0E8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FgbQ8K0E8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FgbQ8K0E8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms