Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZP2

Syn3, Synapsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syn3Q8JZP2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syn3Q8JZP2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syn3Q8JZP2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syn3Q8JZP2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syn3Q8JZP2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syn3Q8JZP2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Syn3Q8JZP2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syn3Q8JZP2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syn3Q8JZP2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syn3Q8JZP2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syn3Q8JZP2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Syn3Q8JZP2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syn3Q8JZP2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Syn3Q8JZP2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Syn3Q8JZP2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syn3Q8JZP2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syn3Q8JZP2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syn3Q8JZP2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syn3Q8JZP2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Syn3Q8JZP2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syn3Q8JZP2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syn3Q8JZP2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syn3Q8JZP2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syn3Q8JZP2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syn3Q8JZP2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syn3Q8JZP2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syn3Q8JZP2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syn3Q8JZP2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syn3Q8JZP2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syn3Q8JZP2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syn3Q8JZP2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Syn3Q8JZP2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syn3Q8JZP2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syn3Q8JZP2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syn3Q8JZP2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syn3Q8JZP2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syn3Q8JZP2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syn3Q8JZP2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syn3Q8JZP2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syn3Q8JZP2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syn3Q8JZP2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syn3Q8JZP2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syn3Q8JZP2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syn3Q8JZP2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syn3Q8JZP2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syn3Q8JZP2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syn3Q8JZP2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syn3Q8JZP2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syn3Q8JZP2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syn3Q8JZP2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms