Protein–RNA interactions for Protein: Q8CID3

Fam20a, Pseudokinase FAM20A, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20aQ8CID3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam20aQ8CID3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam20aQ8CID3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam20aQ8CID3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam20aQ8CID3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam20aQ8CID3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam20aQ8CID3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam20aQ8CID3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam20aQ8CID3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam20aQ8CID3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam20aQ8CID3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam20aQ8CID3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam20aQ8CID3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam20aQ8CID3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam20aQ8CID3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam20aQ8CID3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam20aQ8CID3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam20aQ8CID3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam20aQ8CID3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam20aQ8CID3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam20aQ8CID3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam20aQ8CID3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam20aQ8CID3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam20aQ8CID3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam20aQ8CID3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam20aQ8CID3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam20aQ8CID3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam20aQ8CID3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam20aQ8CID3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam20aQ8CID3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam20aQ8CID3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam20aQ8CID3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam20aQ8CID3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam20aQ8CID3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam20aQ8CID3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam20aQ8CID3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam20aQ8CID3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam20aQ8CID3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam20aQ8CID3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam20aQ8CID3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam20aQ8CID3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam20aQ8CID3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam20aQ8CID3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam20aQ8CID3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam20aQ8CID3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam20aQ8CID3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam20aQ8CID3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam20aQ8CID3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam20aQ8CID3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms