Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGM2

Rp1l1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1l1Q8CGM2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rp1l1Q8CGM2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rp1l1Q8CGM2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rp1l1Q8CGM2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rp1l1Q8CGM2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rp1l1Q8CGM2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rp1l1Q8CGM2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rp1l1Q8CGM2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rp1l1Q8CGM2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rp1l1Q8CGM2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rp1l1Q8CGM2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rp1l1Q8CGM2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rp1l1Q8CGM2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rp1l1Q8CGM2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rp1l1Q8CGM2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rp1l1Q8CGM2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rp1l1Q8CGM2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rp1l1Q8CGM2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rp1l1Q8CGM2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rp1l1Q8CGM2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rp1l1Q8CGM2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rp1l1Q8CGM2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rp1l1Q8CGM2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rp1l1Q8CGM2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rp1l1Q8CGM2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rp1l1Q8CGM2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rp1l1Q8CGM2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rp1l1Q8CGM2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rp1l1Q8CGM2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rp1l1Q8CGM2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rp1l1Q8CGM2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rp1l1Q8CGM2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rp1l1Q8CGM2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rp1l1Q8CGM2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rp1l1Q8CGM2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rp1l1Q8CGM2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rp1l1Q8CGM2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rp1l1Q8CGM2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rp1l1Q8CGM2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rp1l1Q8CGM2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rp1l1Q8CGM2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rp1l1Q8CGM2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rp1l1Q8CGM2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rp1l1Q8CGM2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rp1l1Q8CGM2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rp1l1Q8CGM2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rp1l1Q8CGM2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rp1l1Q8CGM2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rp1l1Q8CGM2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rp1l1Q8CGM2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rp1l1Q8CGM2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rp1l1Q8CGM2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rp1l1Q8CGM2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rp1l1Q8CGM2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rp1l1Q8CGM2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rp1l1Q8CGM2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rp1l1Q8CGM2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rp1l1Q8CGM2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms