Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc63Q8CDV6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc63Q8CDV6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms