Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG5

Crebrf, CREB3 regulatory factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrebrfQ8CDG5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CrebrfQ8CDG5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CrebrfQ8CDG5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CrebrfQ8CDG5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CrebrfQ8CDG5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CrebrfQ8CDG5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CrebrfQ8CDG5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CrebrfQ8CDG5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CrebrfQ8CDG5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CrebrfQ8CDG5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CrebrfQ8CDG5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CrebrfQ8CDG5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CrebrfQ8CDG5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms