Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCX5

Krt222, Keratin-like protein KRT222, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt222Q8CCX5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt222Q8CCX5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt222Q8CCX5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt222Q8CCX5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt222Q8CCX5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt222Q8CCX5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt222Q8CCX5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt222Q8CCX5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt222Q8CCX5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt222Q8CCX5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt222Q8CCX5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt222Q8CCX5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt222Q8CCX5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt222Q8CCX5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt222Q8CCX5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt222Q8CCX5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt222Q8CCX5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt222Q8CCX5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt222Q8CCX5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt222Q8CCX5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt222Q8CCX5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt222Q8CCX5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt222Q8CCX5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt222Q8CCX5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt222Q8CCX5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt222Q8CCX5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt222Q8CCX5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt222Q8CCX5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Krt222Q8CCX5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt222Q8CCX5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt222Q8CCX5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt222Q8CCX5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt222Q8CCX5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt222Q8CCX5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt222Q8CCX5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt222Q8CCX5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt222Q8CCX5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt222Q8CCX5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt222Q8CCX5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt222Q8CCX5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt222Q8CCX5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt222Q8CCX5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt222Q8CCX5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt222Q8CCX5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt222Q8CCX5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt222Q8CCX5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt222Q8CCX5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt222Q8CCX5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt222Q8CCX5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt222Q8CCX5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt222Q8CCX5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt222Q8CCX5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt222Q8CCX5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt222Q8CCX5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt222Q8CCX5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt222Q8CCX5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt222Q8CCX5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt222Q8CCX5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt222Q8CCX5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt222Q8CCX5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt222Q8CCX5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms