Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ephb1Q8CBF3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ephb1Q8CBF3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ephb1Q8CBF3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
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