Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrn3Q8CBC6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms